J2SEのヒープサイズはサーバモードでは物理メモリの1/4もしくは1GBの小さい方にする。 Linuxの共有メモリは/etc/sysctl.confで変更。最適な値はアプリごとに算出（大概DBにあわせるものだと思うけど）。 PostgreSQLのカーネルチューニングパラメータ http://…